Nel 1970 Etaliano Bontempo documentò la presenza di numerose specie officinali coltivate nel Giardino, tra cui cit. Angelica archangelica L., Artemisia absinthium L., Anthemis nobilis L., Gentiana spp, Hyssopus officinalis L., Lavandula officinalis Chaix, Mentha spp., Salvia spp., Thymus vulgaris L., Valeriana officinalis L. e molte altre (Flora appenninica e piante officinali nel Giardino di Capracotta nell’Alto Molise, in «L’Italia Agricola 1972. Tuttavia, proprio nello stesso anno, un telegramma conservato nell’archivio comunale, inviato dal giardiniere Antonio Caiazzo, collaboratore di Merola, segnalava il crescente stato di abbandono del Giardino, che entrò così in una fase di lunga inattività.

La rinascita arrivò nel 1997, quando ripresero le attività di progettazione di percorsi, coltivazione, conservazione e studio. In questa fase, accanto al Comune di Capracotta, si affiancò con continuità l’Università degli Studi del Molise, inizialmente con un ruolo di consulenza scientifica e successivamente come partner nella gestione diretta, con la figura del Direttore e Responsabile scientifico.

Nel 2003 il Comune di Capracotta e l’Università degli studi del Molise costituirono il Consorzio del Giardino della Flora Appenninica, con l’adozione del primo statuto. Successivamente aderirono al Consorzio la Regione Molise, la Provincia di Isernia e la Comunità Montana “Alto Molise” Agnone (nel 2015 la Provincia di Isernia l e la Comunità Montana di Agnone sono uscite per effetto della Legge 190/2014).

Oggi il Giardino è un luogo riconosciuto, valorizzato e nuovamente vivo: è, soprattutto, è un progetto in movimento.  La sua storia insegna che le radici più forti resistono al tempo e, proprio come le piante montane, sanno tornare a fiorire anche dopo le stagioni più dure.